A adubação é uma operação de grande importância que consiste no fornecimento de adubos ou fertilizantes ao solo. Esta é realizada para que haja uma supressão da carência de nutrientes, facilitando assim o desenvolvimento das plantas. A Flopen executa dois tipos de adubação: a adubação de fundo e a adubação de cobertura. A adubação de fundo é efectuada com adubo de libertação lenta (fornece os nutrientes necessários às plantas durante 9 meses) aquando a plantação. A adubação de cobertura é efectuada quando as árvores necessitam de determinado nutriente. A fase em que esta adubação deve ser realizada depende, essencialmente, da espécie instalada. Esta última pode ser efectuada manual ou mecanicamente.